أصدر الرئيس عبد الفتاح السيسي القرار رقم ٧٩ لسنة ٢٠٢٥ بإعادة تشكيل مجلس إدارة هيكل أوقاف الكنيسة الكاثوليكية لمدة ٤ سنوات برئاسة بطريرك الأقباط الكاثوليك.
كما أصدر القرار رقم ٨٠ لسنة ٢٠٢٥ مجلس إدارة هيئة أوقاف الكنيسة الإنجيليّة لمدة ٤ سنوات برئاسة رئيس الطائفة الإنجيليّة ورئيس المجلس الإنجيلي العام.