تحظي صحراء الوادى الجديد بشهرة عالمية لكونها معالم سياحية فريدة بالإضافة لتميز المحافظة بالمناخ الجاف والطقس المشمس الدافئ أغلـب فترات العام وهـذا يؤهلها لتكون مشتى عالمياً .
صحراء الوادي الجديد وكثبانها الرملية المتعددة ومنخفضاتها ومرتفعاتها وجبالها وهضابها كلها عوامل جذب للباحثين فى الجغرافيا الطبيعية ، نظرا لتربتها ومياهها الجوفية وأبارها ونباتاتها الطبية , كما أنها تعتبر قبلة هامة لدراسة الآثار واكتشافاتها بالإضافة لسهولة مواصلاتها وانخفاض سعرها نسبيا مقارنة بطول المسافات التى تبعدها عن محافظات القاهرة والإسكندرية وباقى محافظات الجمهورية، حيث توجد شبكة مواصلات برية بجداول ثابتة طوال اليوم وتستخدم أحدث السيارات المزودة بالواى فاى ووسائل الراحة والترفيه كما توجد رحلات طيران جوى إلى مطار الخارجة ذهابا وعودة.
ومن أهم المواقع السياحية بالمحافظة منطقة الصحراء البيضاء التى تقع على بعد 45 كيلومترا إلى الشمال من واحة الفرافرة على مسافة حوالى 500 كيلومتر من القاهرة وتم إعلانها محمية طبيعية فى عام 2002 وسميت بالصحراء البيضاء لأنها تملك اللون الأبيض الذى يغطى معظم أرجائها، وتبلغ مساحتها الإجمالية 3010 كيلومترات مربعة، وتملك أيضا صخرة ضخمة طباشيرية، تحتوى الصحراء على العديد من التشكيلات التى تم إنشاؤها نتيجة لعاصفة رملية عرضية فى المنطقة، وتعد واحة الفرافرة والصحراء البيضاء المكان النموذجى للزيارة لهواة السفارى ومحبى السياحة البيئية وطلاب المدارس فى وتعد موقعا نموذجيا لرحلات التخييم.
كما تحتوى الصحراء الغربية على منطقة وادى حنس التى تبعد هذه المنطقة بمسافة 55 كم عن مدينة الفرافرة قي اتجاه الشمال وتلقى إقبالاً كبيـراً من السائحين لقضاء ليلة أو أكثر وخاصة في الليالي القمرية ليستمتعوا بجمال الطبيعة الخلابة والجو الجاف النقي من التلوث البيئي وتتميز هذه المناطق بوجود العيون الرومانية المتدفقة وتحيط بهـا كميات كبيرة من أشجار النخيل وأشجار الأكاسيا وتوجد بهذه المناطق بعض الحيوانات والطيور البرية , وهذه المناطق تعد لأن تكون محميات طبيعية .
وتتضمن الصحراء الغربية جبل الكريستال" هو أشهر جبال فى الصحراء الغربية والذى يقع داخل محمية الصحراء البيضاء على بعد 120 كيلومتر من واحة الفرافرة، و160 كيلومتر من الواحات البحرية،والذى اكتسب شهرته لكونه يُعتبر من أندر الجبال في العالم، فهو عبارة عن جبل كامل من خامات الكريستال المختلفة، حيث يوجد به أكثر من 12 نوع من أنواع الكريستال، تتجمع مع بعضها البعض في كتلة جبلية ضخمة كانت زاخرة بالاف القطع الزجاجية الملونة والتى اكتنفها العديد من الروايات بشأن قيمتها المادية التى لا تقدر بثمن.
ومن أهم المعالم السياحية بالفرافرة أيضا كهف الجارة والذي يقع عند نقطة الكيلو 180 امتدادا من مدينة الفرافرة باتجاه محافظة أسيوط، حيث وهو أحد أغرب الأماكن التى يمكن زيارتها فى الصحراء الغربية بمحافظة الوادى الجديد، ويقع فى عمق الأرض بتكوينات رسوبية منذ ملايين السنين، وكان الوصول اليه شديد الصعوبة حتى جرى الانتهاء من تنفيذ محور الفرافرة ديروط أحد أهم مشروعات الطرق القومية والذى يربط محافظة الوادى الجديد من ناحية الفرافرة بمحافظات وادى النيل من ناحية أسيوط وهو ما سها زيارته لمروره بأقرب نقطة من الكهف .
وأبرز ما يتميز به كهف الجارة هو الأشكال الرسوبية الهابطة والصاعدة بالكهف وهى تشبه شلالات المياه المتجمدة، وهى نتيجة لملايين من الأمتار المكعبة من المياه الأرضية التى تسربت خلال رمال الصحراء منذ ملايين من السنين وخلفت هذا الكهف الأرضى ثم جرى ترسيبها وتكثيفها بفعل الحرارة الشديدة، وتمثل الرسوم الجدارية فى الكهف الأنشطة المعتادة لإنسان تلك المنطقة مثل الصيد واللعب، وترجع الرسوم إلى عصر الهولوسين الرطب.
كما تمتاز الوادي الجديد بانتشار الابار العلاجية ذات المياه المعدنية الساخنة التى تفيد فى علاج أمراض المعدة والكلى وفى علاج آلام الروماتيزم والبرد والحساسية فهناك بئر 3 بموط الساخنة والتى تبلغ درجة حرارتها 42 درجة مأوية وعين القصر الحامية بالداخلة وبئر بولاق 5 بالخارجة وهناك من العيون الباردة الكثير ذات المياه العذبة، كما تنتشر الكثبان الرملية الكثيرة المنتشرة فى الواحات والتى تعالج آلام البرد والحساسية والروماتيزم كما تساعد هذه الرمال فى ممارسة سياحة التزحلق على الرمال.