يعتبر الزعتر من الأعشاب المهمة لكثير من الأطعمة كما أن له الكثير من الفوائد التى وضحها دكتور حازم المصرى أخصائى التغذية فى المركز المصرى البريطانى لعلاج السمنة وهى :
-مزيل للبلغم
-مضاد للبكتيريا
-مضاد للفطريات
-مضاد للأكسدةوأوضح أن دواعي استعمال الزعتر هي السعال ذو البلغم ،الالتهاب الشعبي، السعال الديكي، النزلة أو زكام الطرق التنفسية العلوية وأيضًا التهاب الفم و رائحة الفم المزعجة و التهاب اللوزتين.
كما أنه علاج لالتهاب الحنجرة، التهاب الحلق، الحمى المصاحبة للرشح وسوء الهضم، التهاب المعدة المزمن، المغص، الإنتفاخات، الإسهال
وأشار المصرى لطرق استعماله وهي:
-يشرب منه 3 فنجان يوميًا بعد غليه كعلاج للسعال والتهاب الحنجره والحمي والحلق ولسوء الهضم والتهابات المعده
-يشرب منه 3 كوب يوميًا مضاف اليه عصير ليمونه في حالة الاسهال والرشح
-يشرب منه 3 كوب يوميا عند استعماله لحرق الدهون مضاف له قشر البصل
-وفي التهاب اللوزتين يستعمل كسائل للغرغرة.